生信服务器避坑指南【九大坑】(2025详细版,新手必看)
生信共享服务器的由来:
在生信分析中,因为大数据量的原因,往往都需要使用服务器才能实现,而自己组装或者购买公有云服务器,都是一笔不小的开支。所以共享服务器应运而生,用户在一台服务器上错峰使用,让服务器使用效率达到最大化。这样,用户可以以较低的价格享受到高配置的服务器从而完成自己的分析任务。但是这里面的坑也有很多,今天就一一为大家做个详细的剖析,避免踩坑!第九个坑最重要!
01 一台共享服务器人数
一些服务器厂家为了利润最大化,单台服务器上承载了大几十甚至上百人,分配到每个用户的资源严重不足!导致分析速度慢,排队,卡顿等情况,已经失去了购买服务器的意义。
在购买前一定要询问厂家,服务器共享人数,大家都在运行任务时造成资源不够的情况下,是否有解决办法?人数太多,没有技术手段解决的,一律不买!不要贪图便宜,购买过后无法正常使用!
02 拉跨的洋垃圾组装而成的服务器
大部分服务器厂家在宣传的时候,只宣传线程、内存、硬盘的大小,往往对具体的型号只字不提,这是因为从海外购买已经被淘汰的型号拿来组装服务器,可以大幅降低硬件成本的投入,但是带来的结果就是性能严重不足,稳定性降低,导致随时可能因为硬件老化而带来的灾难性崩溃(数据无法恢复)。
在购买前一定要询问厂家,服务器硬件的具体型号,CPU型号、内存型号、硬盘型号以及是否为固态硬盘。不告诉你具体型号的,一律不买!
如果你已经买了,赶紧用下面的命令看看~
查看 CPU 型号:
使用 lscpu 命令:在终端输入lscpu,可显示 CPU 的详细信息,包括型号、核心数、线程数等,如Model name: Intel(R) Xeon(R) Gold 5120 CPU @ 2.20GHz。
使用 cat /proc/cpuinfo 命令:执行cat /proc/cpuinfo,会显示更详细的 CPU 信息,可通过查找model name字段获取 CPU 型号。
使用 dmidecode 命令:输入sudo dmidecode -t processor,可从系统的 DMI 表中提取硬件信息,其中包含 CPU 型号。
查看内存型号:
使用 dmidecode 命令:在终端输入sudo dmidecode -t memory,可查看内存的详细信息,包括型号、容量、速度等。
使用 lshw 命令:执行sudo lshw -C memory,也能获取内存相关信息,从中可找到内存型号等内容。
查看硬盘型号:
使用 smartctl 命令:若系统未安装,需先执行sudo apt install smartmontools(Debian/Ubuntu)或sudo yum install smartmontools(CentOS/RHEL)进行安装。安装后,执行smartctl --all /dev/sdX(sdX替换为实际的磁盘标识符),可查看硬盘型号等信息。
查看 /proc/scsi/scsi 文件:输入cat /proc/scsi/scsi,可显示物理硬盘的个数、对应的接口以及硬盘的具体型号信息。
判断硬盘是否为 SSD1:
使用 lsblk 命令:输入lsblk -d -o name,rota,rota列显示0表示 SSD,显示1表示 HDD。
使用 smartctl 工具:安装 smartmontools 后,执行sudo smartctl -i /dev/sdX,在输出中查找 “Rotation Rate” 项,若为 “Solid State Device” 表示 SSD,若显示具体 RPM 值则为 HDD。
查看 /sys 文件系统:输入cat /sys/block/sdX/queue/rotational,输出0表示 SSD,输出1表示 HDD。
使用 hdparm 命令:执行sudo hdparm -I /dev/sdX | grep Nominal,若没有显示 “Nominal Media Rotation Rate” 或显示 “Solid State Device”,则是 SSD。
使用 lshw 命令:输入sudo lshw -class disk,在输出中查找 “description” 字段,通常会标明是 SSD 还是 HDD。
03 安全性与数据备份
市面上一些服务器厂商团队没有专业的运维人员和运维机制(运维人员需要24小时值守,随时监控服务器状态),让服务器处于“裸奔”状态,攻击、病毒随时都会侵入。一定要选择具备完善防御机制和备份机制并且有专业的运维团队的厂家,这样才能保障你的数据资产以及系统稳定。一般靠谱的服务器厂商会提供免费的备份机制,每天或者每周对数据进行全量备份,哪怕删除错误或者意外被攻击导致数据丢失或者系统损坏,都可以很轻松的复原到备份时间点的状态。
在购买前一定要询问厂家,服务器的安全机制、备份机制、备份是否额外收费,达不到要求的,一律不买!
04 小作坊运营和运维
在小红书、咸鱼、公众号上有一些卖服务器的厂商,他可能只有1个人,甚至公司都没有成立!他可能价格给的很低,但是完全没有售后,随时都可能会跑路!千万不要贪图价格便宜就买了!
在购买前一定要询问厂家,公司名称(简单的百度搜索一下或者企查查看看公司成立时间之类的),是否可以开票,是否可以签订合同,做不到的,一律不买!
05 非独立环境,无ROOT权限
市面上很多共享服务器只是给你一个子账号,给一定的存储空间,从系统上根本就不是独立,这样不仅环境的版本会出现冲突、无法创建子账户,更重要的是会让你的数据有泄露的风险!
在购买前一定要询问厂家,是否独立环境、是否具备root权限,没有的话,一律不买!
06 国际网络
在生信分析中,需要使用到很多海外的软件、数据,如果服务器没有国际网络,则无法下载。前置工作都无法开展,更不用谈后面的分析任务了。
在购买前一定要询问厂家,是否具备国际网络,没有的话,一律不买!
07 售后服务
很多服务器厂家都只有IT技术人员,并没有咱们领域的生信工程师,很多时候出现问题的时候只能自己默默的探索,并不能快速的解决问题。装包或者环境有问题,捣鼓好几天都不能解决!
在购买前一定要询问厂家,是否具备售后支持,是否有生信工程师,是否有售后群,是否有用户交流群,没有的话,酌情考虑不要购买!(如果你技术很好,可以忽略~)
08 按年购买
市面上大部分厂商的共享服务器只能按年购买,而我们分析任务其实并不是持续要做的,实验没做完、测序结果没有的时候,我们也不需要使用到服务器,所以这个时候建议是询问一下厂家是否有按月或者按天购买的产品,能省一分是一分!
09 便宜
市面上有一些服务器便宜到离谱了,几百块就可以用一个高端的服务器,这种必然是有猫腻的!毕竟电费都不止这么多!大家选择的时候一定不要贪图便宜了,要综合性的考量,毕竟一分钱一分货,厂家也不是做慈善的~










